小柳 香奈子

小柳 香奈子
小柳 香奈子

大学院情報科学研究科・生命人間情報科学専攻・
ゲノム情報科学研究室

職名 准教授
学位 博士(理学)
専門 分子進化学、ゲノム学、生命情報学

現在の教育研究内容

様々な生物のゲノムを比較解析することにより、ヒトなどのゲノムの進化過程に関する研究を行っている。また共同研究により、ウィルスゲノムに関する応用研究にも取り組んでいる。医学研究科との共同研究では、流行性角結膜炎の原因ウィルスであるアデノウィルスに関して、新型ウィルスの出現過程の推定や感染・発症に関わるウィルスゲノム領域の特定に取り組んでいる。また農学研究院との共同研究では、イネツングロ病の原因ウィルスに関して、ウィルスゲノムがイネゲノムとどう関わり合って進化してきたかについて研究を行っている。このように、ゲノム情報解析から遺伝情報と表現型との関連や生物多様性・進化を解明することを目指している。

本プログラムにおける役割

  1. 獣医学研究科博士課程における情報科学教育の推進

主な発表論文 ※主要5点を抜粋

  1. Yamada A, Koyanagi KO, Watanabe H. (2011) In silico and in vivo identification of the intermediate filament vimentin that is downregulated downstream of Brachyury during Xenopus embryogenesis. Gene 491(2):232-6..
  2. Kaneko H, Aoki K, Ishida S, Ohno S, Kitaichi N, Ishiko H, Fujimoto T, Ikeda Y, Nakamura M, Gonzalez G, Koyanagi KO, Watanabe H, Suzutani T. (2011) Recombination analysis of intermediate human adenovirus type 53 in Japan by complete genome sequence. J. Gen. Virol. 92:1251-9.
  3. Kaneko H, Aoki K, Ohno S, Ishiko H, Fujimoto T, Kikuchi M, Harada S, Gonzalez G, Koyanagi KO, Watanabe H, Suzutani T. (2011) Complete genome analysis of a novel intertypic recombinant human adenovirus causing epidemic keratoconjunctivitis in Japan. J. Clin. Microbiol. 49(2):484-90.
  4. Tanaka T, Koyanagi KO, Itoh T. (2009) Highly diversified molecular evolution of downstream transcription start sites in rice and Arabidopsis. Plant Physiology 149(3):1316-1324
  5. Koyanagi KO, Imanishi T, Gojobori T. (2008) Bidirectional Gene Pairs in the Human Genome. ENCYCLOPEDIA OF LIFE SCIENCES DOI: 10.1002/9780470015902.a0020776
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